Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ptpn20O55082 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms