Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sp100O35892 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sp100O35892 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
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Sp100O35892 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms