Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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Dgcr6O35347 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Dgcr6O35347 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Dgcr6O35347 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Dgcr6O35347 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Dgcr6O35347 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Dgcr6O35347 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Dgcr6O35347 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Dgcr6O35347 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Dgcr6O35347 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Dgcr6O35347 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Dgcr6O35347 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Dgcr6O35347 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Dgcr6O35347 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Dgcr6O35347 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms