Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Eftud2O08810 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Eftud2O08810 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms