Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC117090L7N257 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BC117090L7N257 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC117090L7N257 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC117090L7N257 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC117090L7N257 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC117090L7N257 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC117090L7N257 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC117090L7N257 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC117090L7N257 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC117090L7N257 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC117090L7N257 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC117090L7N257 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BC117090L7N257 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BC117090L7N257 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
BC117090L7N257 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BC117090L7N257 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BC117090L7N257 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BC117090L7N257 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BC117090L7N257 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BC117090L7N257 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
BC117090L7N257 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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BC117090L7N257 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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BC117090L7N257 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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BC117090L7N257 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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BC117090L7N257 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC117090L7N257 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC117090L7N257 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC117090L7N257 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC117090L7N257 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC117090L7N257 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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BC117090L7N257 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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