Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Gm379J3QQ19 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Gm379J3QQ19 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
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Gm379J3QQ19 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Gm379J3QQ19 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Gm379J3QQ19 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Gm379J3QQ19 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Gm379J3QQ19 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Gm379J3QQ19 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Gm379J3QQ19 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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