Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms