Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Ap2b1-201ENSMUST00000018875 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm5849J3QPE5 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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