Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Smim18J3QNP2 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim18J3QNP2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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