Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm3727J3QM54 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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