Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem200cJ3QK46 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms