Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI9

Gm21719, Predicted gene, 21719, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21719J3KMI9 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gm21719J3KMI9 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gm21719J3KMI9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21719J3KMI9 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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