Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm29394H3BIW7 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm29394H3BIW7 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm29394H3BIW7 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm29394H3BIW7 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm29394H3BIW7 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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