Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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