Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ScaperF8VQ70 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms