Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm12946-201ENSMUST00000122969 519 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Usp9yF8VPU6 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Usp9yF8VPU6 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Usp9yF8VPU6 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Usp9yF8VPU6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Usp9yF8VPU6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Usp9yF8VPU6 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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Usp9yF8VPU6 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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Usp9yF8VPU6 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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Usp9yF8VPU6 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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Usp9yF8VPU6 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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Usp9yF8VPU6 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Usp9yF8VPU6 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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