Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Zfp988F6VKC7 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Zfp988F6VKC7 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Zfp988F6VKC7 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Zfp988F6VKC7 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Zfp988F6VKC7 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Zfp988F6VKC7 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Zfp988F6VKC7 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Zfp988F6VKC7 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Zfp988F6VKC7 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Zfp988F6VKC7 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Zfp988F6VKC7 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Zfp988F6VKC7 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Zfp988F6VKC7 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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