Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Fndc1E9Q043 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms