Protein–RNA interactions for Protein: E9PZP8

Herc1, HECT and RLD domain-containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 4,859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc1E9PZP8 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Herc1E9PZP8 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Herc1E9PZP8 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Herc1E9PZP8 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Herc1E9PZP8 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Herc1E9PZP8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Herc1E9PZP8 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Herc1E9PZP8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Herc1E9PZP8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Herc1E9PZP8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Herc1E9PZP8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Herc1E9PZP8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Herc1E9PZP8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Herc1E9PZP8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Herc1E9PZP8 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Herc1E9PZP8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Herc1E9PZP8 Gm16480-201ENSMUST00000120439 832 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Herc1E9PZP8 Gm8577-201ENSMUST00000122420 986 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Herc1E9PZP8 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Herc1E9PZP8 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Herc1E9PZP8 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Herc1E9PZP8 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Herc1E9PZP8 Atp5g3-201ENSMUST00000018914 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Herc1E9PZP8 Ift22-204ENSMUST00000200153 670 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Herc1E9PZP8 Gnpnat1-202ENSMUST00000226276 710 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Herc1E9PZP8 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Herc1E9PZP8 Gm8174-201ENSMUST00000064353 1001 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Herc1E9PZP8 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Herc1E9PZP8 Gm10689-201ENSMUST00000098864 432 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Herc1E9PZP8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Herc1E9PZP8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Herc1E9PZP8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Herc1E9PZP8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Herc1E9PZP8 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Herc1E9PZP8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Herc1E9PZP8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Herc1E9PZP8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Herc1E9PZP8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Herc1E9PZP8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Herc1E9PZP8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Gm14676-201ENSMUST00000117722 858 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Gm16574-201ENSMUST00000159301 745 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 3110009E18Rik-201ENSMUST00000027637 1007 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Rdh7-201ENSMUST00000047199 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Gm25804-201ENSMUST00000122785 188 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Gm39090-201ENSMUST00000205284 972 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Gm16410-201ENSMUST00000094550 774 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Bcas1os2-201ENSMUST00000131931 1174 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Gm24300-201ENSMUST00000177809 109 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Gm24017-201ENSMUST00000178726 109 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Gm23952-201ENSMUST00000179380 109 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Gm19705-204ENSMUST00000181524 413 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Herc1E9PZP8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms