Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gpx6-201ENSMUST00000004453 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 AC161374.2-201ENSMUST00000223662 596 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gcn1E9PVA8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms