Protein–RNA interactions for Protein: C0HKD8

Mfap1a, Microfibrillar-associated protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfap1aC0HKD8 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mfap1aC0HKD8 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms