Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Phf11bB4XVQ1 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.9 ms