Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms