Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms