Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms