Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ssxb8B1AY40 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ssxb8B1AY40 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ssxb8B1AY40 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ssxb8B1AY40 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ssxb8B1AY40 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ssxb8B1AY40 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ssxb8B1AY40 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ssxb8B1AY40 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Ssxb8B1AY40 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Ssxb8B1AY40 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Ssxb8B1AY40 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Ssxb8B1AY40 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssxb8B1AY40 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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