Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms