Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms