Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
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