Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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