Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cib1Q9Z0F4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118 ms