Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Psma4Q9R1P0 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma4Q9R1P0 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma4Q9R1P0 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma4Q9R1P0 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma4Q9R1P0 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma4Q9R1P0 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Psma4Q9R1P0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms