Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms