Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gpc6Q9R087 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gpc6Q9R087 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gpc6Q9R087 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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