Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Tnnt3Q9QZ47 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
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Tnnt3Q9QZ47 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Tnnt3Q9QZ47 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Tnnt3Q9QZ47 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Tnnt3Q9QZ47 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Tnnt3Q9QZ47 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Tnnt3Q9QZ47 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Tnnt3Q9QZ47 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Tnnt3Q9QZ47 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Tnnt3Q9QZ47 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnnt3Q9QZ47 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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