Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms