Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms