Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Col5a3Q9JLI2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms