Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Tlr5Q9JLF7 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Tlr5Q9JLF7 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Tlr5Q9JLF7 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Tlr5Q9JLF7 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Tlr5Q9JLF7 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Tlr5Q9JLF7 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tlr5Q9JLF7 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tlr5Q9JLF7 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tlr5Q9JLF7 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Tlr5Q9JLF7 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tlr5Q9JLF7 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tlr5Q9JLF7 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tlr5Q9JLF7 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tlr5Q9JLF7 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tlr5Q9JLF7 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tlr5Q9JLF7 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tlr5Q9JLF7 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tlr5Q9JLF7 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tlr5Q9JLF7 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tlr5Q9JLF7 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tlr5Q9JLF7 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tlr5Q9JLF7 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tlr5Q9JLF7 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tlr5Q9JLF7 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tlr5Q9JLF7 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tlr5Q9JLF7 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tlr5Q9JLF7 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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