Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hmgn5Q9JL35 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hmgn5Q9JL35 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hmgn5Q9JL35 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hmgn5Q9JL35 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hmgn5Q9JL35 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hmgn5Q9JL35 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hmgn5Q9JL35 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hmgn5Q9JL35 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hmgn5Q9JL35 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hmgn5Q9JL35 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hmgn5Q9JL35 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hmgn5Q9JL35 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hmgn5Q9JL35 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hmgn5Q9JL35 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
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