Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms