Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Trim39Q9ESN2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Trim39Q9ESN2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Trim39Q9ESN2 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Trim39Q9ESN2 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Trim39Q9ESN2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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