Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rb1cc1Q9ESK9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rb1cc1Q9ESK9 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Rb1cc1Q9ESK9 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Rb1cc1Q9ESK9 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Rb1cc1Q9ESK9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Rb1cc1Q9ESK9 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rb1cc1Q9ESK9 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rb1cc1Q9ESK9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Rb1cc1Q9ESK9 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Rb1cc1Q9ESK9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Rb1cc1Q9ESK9 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Rb1cc1Q9ESK9 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rb1cc1Q9ESK9 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Rb1cc1Q9ESK9 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rb1cc1Q9ESK9 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rb1cc1Q9ESK9 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rb1cc1Q9ESK9 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rb1cc1Q9ESK9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rb1cc1Q9ESK9 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rb1cc1Q9ESK9 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rb1cc1Q9ESK9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rb1cc1Q9ESK9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rb1cc1Q9ESK9 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rb1cc1Q9ESK9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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