Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
DysfQ9ESD7 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DysfQ9ESD7 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
DysfQ9ESD7 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DysfQ9ESD7 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DysfQ9ESD7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DysfQ9ESD7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DysfQ9ESD7 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DysfQ9ESD7 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DysfQ9ESD7 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
DysfQ9ESD7 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
DysfQ9ESD7 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DysfQ9ESD7 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DysfQ9ESD7 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
DysfQ9ESD7 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
DysfQ9ESD7 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DysfQ9ESD7 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DysfQ9ESD7 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DysfQ9ESD7 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
DysfQ9ESD7 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DysfQ9ESD7 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DysfQ9ESD7 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DysfQ9ESD7 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
DysfQ9ESD7 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DysfQ9ESD7 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DysfQ9ESD7 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DysfQ9ESD7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DysfQ9ESD7 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DysfQ9ESD7 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DysfQ9ESD7 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DysfQ9ESD7 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DysfQ9ESD7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
DysfQ9ESD7 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms