Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Usp29Q9ES63 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Usp29Q9ES63 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Usp29Q9ES63 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Usp29Q9ES63 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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