Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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