Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms