Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc97Q9DBT3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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