Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Swt1Q9DBQ9 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Swt1Q9DBQ9 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Swt1Q9DBQ9 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Swt1Q9DBQ9 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Swt1Q9DBQ9 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Swt1Q9DBQ9 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Swt1Q9DBQ9 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Swt1Q9DBQ9 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Swt1Q9DBQ9 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Swt1Q9DBQ9 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Swt1Q9DBQ9 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Swt1Q9DBQ9 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Swt1Q9DBQ9 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Swt1Q9DBQ9 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Swt1Q9DBQ9 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Swt1Q9DBQ9 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Swt1Q9DBQ9 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Swt1Q9DBQ9 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Swt1Q9DBQ9 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Swt1Q9DBQ9 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Swt1Q9DBQ9 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Swt1Q9DBQ9 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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