Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Med27Q9DB40 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms